<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Dear Luiz,</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Your approach (refine one parameter & then refine the other) does not produce valid results or estimated standard deviations (sigmas). There is a significant difference in the functions for size and mustrain with respect to scattering angle so they should not
 be so correlated that they can't be refined simultaneously. One depends on 1/cos(theta) while the other is dependent on tan(theta). Unless your sample is "nanocrystalline" (size << 1 micron) the dominant broadening is almost invariably due to mustrain & you
 should refine accordingly. If you want to explore this, set size to a few fixed values (< 1 micron) & refine just mustrain. NB: for laboratory instruments, size >1 micron is meaningless as that size is effectively infinite for diffraction.</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Bob</div>
<div id="appendonsend"></div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> GSAS-II <gsas-ii-bounces@aps.anl.gov> on behalf of Luiz Felipe Pompermaier via GSAS-II <gsas-ii@aps.anl.gov><br>
<b>Sent:</b> Monday, December 16, 2024 12:21 PM<br>
<b>To:</b> Luiz Felipe via GSAS-II <gsas-ii@aps.anl.gov><br>
<b>Subject:</b> [GSAS-II] Query on Exporting Error Values for Size and Microstrain in GSAS-II</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div style="display:none!important; display:none; visibility:hidden; font-size:1px; color:#ffffff; line-height:1px; height:0px; max-height:0px; opacity:0; overflow:hidden">
Dear GSAS-II Community, I hope this message finds you well. I would like to know if there is a way to export the error (sigma) associated with the size and microstrain values to the .lst file after completing a refinement. To provide some context: </div>
<div style="display:none!important; display:none; visibility:hidden; font-size:1px; color:#ffffff; line-height:1px; max-height:0px; opacity:0; overflow:hidden">
ZjQcmQRYFpfptBannerStart</div>
<div dir="ltr" id="x_pfptBannero6w2hzu" style="display:block!important; text-align:left!important; margin:16px 0px 16px 0px!important; padding:8px 16px 8px 16px!important; border-radius:4px!important; min-width:200px!important; background-color:#D0D8DC!important; background-color:#D0D8DC; border-top:4px solid #90a4ae!important; border-top:4px solid #90a4ae">
<div id="x_pfptBannero6w2hzu" style="float:left!important; display:block!important; margin:0px 0px 1px 0px!important; max-width:600px!important">
<div id="x_pfptBannero6w2hzu" style="display:block!important; visibility:visible!important; background-color:#D0D8DC!important; color:#000000!important; color:#000000; font-family:'Arial',sans-serif!important; font-family:'Arial',sans-serif; font-weight:bold!important; font-weight:bold; font-size:14px!important; line-height:18px!important; line-height:18px">
This Message Is From an External Sender </div>
<div id="x_pfptBannero6w2hzu" style="display:block!important; visibility:visible!important; background-color:#D0D8DC!important; color:#000000!important; color:#000000; font-weight:normal; font-family:'Arial',sans-serif!important; font-family:'Arial',sans-serif; font-size:12px!important; line-height:18px!important; line-height:18px; margin-top:2px!important">
This message came from outside your organization. </div>
</div>
<div style="clear:both!important; display:block!important; visibility:hidden!important; line-height:0!important; font-size:0.01px!important; height:0px">
 </div>
</div>
<div style="display:none!important; display:none; visibility:hidden; font-size:1px; color:#ffffff; line-height:1px; max-height:0px; opacity:0; overflow:hidden">
ZjQcmQRYFpfptBannerEnd</div>
<style>
<!--
#x_pfptBannero6w2hzu
        {display:block!important;
        visibility:visible!important;
        opacity:1!important;
        background-color:#D0D8DC!important;
        max-width:none!important;
        max-height:none!important}
-->
</style><style type="text/css" style="display:none">
<!--
p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}
-->
</style>
<div class="x_elementToProof" style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Dear GSAS-II Community,</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
I hope this message finds you well.</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
I would like to know if there is a way to export the error (sigma) associated with the size and microstrain values to the .lst file after completing a refinement.</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
To provide some context: given the strong correlation between size and microstrain, I avoid refining them simultaneously. Instead, I refine one parameter at a time, alternating between them a few times, and then disable the refinement flags once I achieve satisfactory
 values.</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
However, this approach presents a challenge: by removing the refinement flags, I lose the sigma values associated with these variables, as they are no longer being actively refined. I would like to preserve the final sigma values in the .lst report.</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Is there a way to achieve this within GSAS-II? Alternatively, would you recommend revisiting my refinement strategy?</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Thank you in advance for your time and assistance.</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Best regards,</div>
<div class="x_elementToProof" style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Luiz Felipe Pompermaier</div>
<div id="x_Signature" class="x_elementToProof" style="color:inherit"></div>
</div>
</body>
</html>